El pontificado de Alejandro II comenzó en un momento de tensión, con la reciente promulgación del decreto de Nicolás II (1059) que otorgaba virtualmente el derecho de elección papal al Colegio Cardenalicio,,. Este decreto fue el punto central de la disputa que surgió tras la muerte del Papa Nicolás II en 1061,.
La elección de Alejandro II
Tras la muerte de Nicolás II, las dos facciones principales estaban listas para la batalla. Los «hildebrandistas», apoyados por los cardenales, propusieron a Anselmo de Lucca. Los cardenales se reunieron formalmente y eligieron a Anselmo, quien tomó el nombre de Alejandro II.
Antes de su entronización, el Sacro Colegio notificó a la corte alemana su decisión. Los alemanes fueron considerados como habiendo perdido el privilegio de confirmar la elección, un derecho que el decreto de Nicolás II había reservado a su rey con una vaguedad intencionada. El embajador de los cardenales fue despedido sin ser escuchado, lo que llevó a los cardenales a completar la elección con la ceremonia de entronización el 30 de septiembre de 1061, previendo una guerra civil,.
El antipapa Honorio II (Cadalus)
Mientras tanto, una delegación de nobles romanos, indignados por su exclusión como factor dominante en las elecciones papales, se unió a obispos lombardos no reformados y se dirigió a la corte alemana,. La emperatriz Inés, regente de su hijo de diez años, Enrique IV, convocó una asamblea en Basilea,. Allí, sin derecho legal y sin la presencia de un solo cardenal, Cadalus, obispo de Parma, fue declarado Papa y tomó el nombre de Honorio II el 28 de octubre,.
La resolución del conflicto
En el conflicto subsiguiente, Alejandro II recibió el apoyo de la opinión pública que clamaba por la reforma, la ayuda de los normandos aliados del sur de Italia, y la benevolencia de Beatriz y Matilde de Toscana. En Alemania, la situación también le fue favorable cuando Anno de Colonia tomó la regencia y la emperatriz arrepentida se retiró a un convento,.
En un nuevo concilio celebrado en Augsburgo en octubre de 1062, se decidió que Burchard, obispo de Halberstadt, investigaría la elección de Alejandro en Roma y presentaría un informe. El informe de Burchard fue completamente favorable a Alejandro.
Alejandro II defendió su causa con elocuencia en un concilio en Mantua en Pentecostés de 1064, donde fue formalmente reconocido como el Papa legítimo,. Su rival fue excomulgado, pero continuó la contienda con perspectivas decrecientes hasta su muerte en 1072.
