Reforma de Sixto V y ampliación de competencias (1588)
El Concilio de la Reforma de la Curia, impulsado por el Papa Sixto V mediante la constitución Immensa aeterni Dei (22 de enero de 1588), extendió las atribuciones de la Inquisición a todo lo relacionado directa o indirectamente con la fe y la moral, consolidando su papel como autoridad central en la defensa doctrinal.
Cambios bajo el papado de Pablo IV y la creación de la Congregación del Índice (1571)
En 1571, el Papa Pío V fundó la Congregación para la Reforma del Índice de Libros Prohibidos, cuya tarea de censura quedó bajo la supervisión de la Inquisición durante más de tres siglos, reforzando el control sobre la difusión de ideas consideradas peligrosas para la fe.
Reorganización de Pío X (1908) – Congregación del Santo Oficio
El Papa Pío X, con la constitución Sapienti consilio (29 de junio 1908), renombró la institución como Congregación del Santo Oficio, manteniendo su función de defensa de la ortodoxia pero adaptando su estructura a los nuevos retos del siglo XX,.
Transformación del Concilio Vaticano II y Integrae servandae (1965) – Congregación para la Doctrina de la Fe
En el contexto del Concilio Vaticano II, el Papa Pablo VI promulgó el motu proprio Integrae servandae (7 de diciembre 1965), cambiando el nombre a Congregación para la Doctrina de la Fe y modificando su método de actuación: de una tendencia punitiva a una actitud más pastoral, centrada en la corrección amable y la promoción del evangelio,. Esta reforma subrayó la necesidad de que los fieles comprendan las razones detrás de las definiciones doctrinales, favoreciendo la adhesión por amor y no por miedo.