Una de las características principales de San Luis IX fue su compromiso con sus deberes como soberano nacional y sus obligaciones hacia la Cristiandad. Aprovechando un respiro de paz, dirigió sus pensamientos hacia las Cruzadas.
Séptima Cruzada (1248-1249)
En 1244, Luis enfermó gravemente y, al recuperarse, hizo un voto de tomar la cruz al enterarse de que los turcomanos habían derrotado a los cristianos y musulmanes e invadido Jerusalén,. A pesar de la oposición de sus consejeros y nobles, partió para Chipre en 1248, con el objetivo de Egipto. Damietta fue tomada fácilmente, y Luis hizo una entrada solemne en la ciudad, no con la pompa de un conquistador, sino con la humildad de un príncipe cristiano, caminando descalzo con la reina, sus hermanos y otros grandes señores, precedido por el legado papal.
Durante esta cruzada, el rey fue tomado prisionero en abril de 1250, y su ejército fue masacrado. Durante su cautiverio, Luis mantuvo su dignidad y fe, recitando el Oficio Divino diariamente. Cuando el sultán exigió un millón de bezantes de oro y la ciudad de Damietta por su rescate, Luis respondió que un rey de Francia no debía redimirse por dinero, pero que daría la ciudad por su propia liberación y el millón de bezantes por la de todos los demás prisioneros. Fue liberado bajo estos términos. Permaneció en Palestina hasta 1254, visitando los lugares santos, animando a los cristianos y fortaleciendo las defensas del reino latino. Regresó a Francia tras la noticia de la muerte de su madre, pero continuó llevando la cruz en su ropa, mostrando su intención de regresar a ayudar a los cristianos de Oriente.
Octava Cruzada (1270)
La situación de los cristianos en Oriente empeoró rápidamente entre 1263 y 1268. En 1267, San Luis IX anunció otra cruzada. En un parlamento celebrado en París el 24 de marzo de 1267, él y sus tres hijos tomaron la cruz. A pesar de los informes de los misioneros, Luis decidió desembarcar en Túnez, esperando convertir a su príncipe al cristianismo.
Los cruzados, entre los que se encontraba el príncipe Eduardo de Inglaterra, desembarcaron en Cartago el 17 de julio de 1270. Sin embargo, la peste estalló en su campamento, y el 25 de agosto de 1270, San Luis IX falleció a causa de la enfermedad,,. Antes de su muerte, dio sus últimas instrucciones a sus hijos e hija, y recibió los últimos sacramentos. Urgió a los embajadores griegos a la reunificación con la Iglesia Romana. Sus últimas palabras registradas fueron: «Señor, entraré en tu casa; adoraré en tu santo templo y daré gloria a tu nombre» y «En tus manos encomiendo mi alma».