Durante su interrogatorio, Quirino fue cuestionado sobre su intento de escape. Él respondió que simplemente obedecía a su Maestro, Jesucristo, el Dios verdadero, quien había dicho: «Cuando os persigan en una ciudad, huid a otra». El magistrado Máximo le preguntó si no sabía que las órdenes del emperador lo encontrarían en cualquier lugar y que el Dios que él llamaba verdadero no podría ayudarlo. A esto, Quirino declaró: «Dios está siempre con nosotros y puede ayudarnos». Afirmó que Dios estuvo con él cuando fue capturado y que lo fortalecía y hablaba a través de sus labios.
Máximo observó que Quirino hablaba mucho y posponía obedecer los mandatos de los soberanos, instándolo a leer los edictos y cumplir con ellos. Quirino se negó, protestando que no podía consentir lo que sería un sacrilegio. Exclamó que los dioses que servían los paganos no eran nada, mientras que su Dios, a quien servía, estaba en el Cielo, la tierra, el mar y en todas partes, siendo superior a todo porque lo contiene todo en sí mismo, y todas las cosas fueron creadas y subsisten por Él solo. El juez declaró que debía estar en su segunda infancia para creer tales fábulas y le ofreció incienso para sacrificar.
Quirino respondió que los dolores amenazados serían una gloria para él, y Máximo ordenó que fuera golpeado. Incluso mientras se ejecutaba la sentencia, se le instó a sacrificar y se le prometió que si lo hacía, sería nombrado sacerdote de Júpiter. El mártir, impávido, exclamó: «Estoy ejerciendo mi sacerdocio aquí y ahora ofreciéndome a Dios». Añadió que se alegraba de ser golpeado, que no le dolía, y que con gusto soportaría un trato mucho peor para animar a aquellos sobre quienes había presidido a seguirlo por un camino corto hacia la vida eterna.
Como Máximo no tenía autoridad para dictar una sentencia de muerte, decidió enviar a Quirino al gobernador de Pannonia Prima, Amancio. El obispo fue llevado por varias ciudades a lo largo del Danubio hasta llegar a Sabaria (actual Szombathely, Hungría). Ante Amancio, Quirino reafirmó su confesión de fe, diciendo: «He confesado al Dios verdadero en Siscia, nunca he adorado a ningún otro. Lo llevo en mi corazón, y ningún hombre en la tierra logrará separarme de Él».
Amancio, aunque reacio a torturar y destruir a alguien de su venerable edad, y a pesar de sus promesas y amenazas, no pudo mover al santo. Por lo tanto, el gobernador no tuvo más opción que condenarlo. Quirino fue sentenciado a muerte y arrojado al río Raab con una piedra atada al cuello,,. No se hundió inmediatamente y se le escuchó pronunciar palabras de oración o exhortación antes de desaparecer de la vista. Su cuerpo, arrastrado un poco río abajo, fue rescatado por los cristianos. El martirio de San Quirino tuvo lugar en el año 309,.
